Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL4A5P29400 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms