Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5AP29375 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM5AP29375 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms