Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E2P29084 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms