Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMLP26374 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMLP26374 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMLP26374 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMLP26374 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMLP26374 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMLP26374 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMLP26374 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms