Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR4P22455 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR4P22455 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms