Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDSP20132 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDSP20132 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDSP20132 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDSP20132 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDSP20132 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDSP20132 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDSP20132 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDSP20132 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDSP20132 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDSP20132 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDSP20132 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms