Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPI1P17947 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPI1P17947 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPI1P17947 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms