Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTLA4P16410 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms