Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC5A1P13866 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms