Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRG2P13727 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRG2P13727 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms