Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms