Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA4P13612 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms