Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD4P09016 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD4P09016 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms