Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PKHD1P08F94 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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