Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB3P05106 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGB3P05106 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms