Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms