Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A1P02462 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL4A1P02462 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL4A1P02462 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms