Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL2A1P02458 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL2A1P02458 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms