Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOSP01100 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOSP01100 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOSP01100 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOSP01100 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOSP01100 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOSP01100 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms