Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2P00734 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2P00734 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2P00734 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2P00734 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2P00734 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2P00734 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2P00734 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2P00734 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
F2P00734 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
F2P00734 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2P00734 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2P00734 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2P00734 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2P00734 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2P00734 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2P00734 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2P00734 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms