Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHOBTB3O94955 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBTB3O94955 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms