Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSDE1O75534 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSDE1O75534 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms