Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA4O75335 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA4O75335 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms