Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGSF3O75054 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms