Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBNO60934 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBNO60934 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NBNO60934 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NBNO60934 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBNO60934 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NBNO60934 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBNO60934 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBNO60934 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NBNO60934 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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