Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNND1O60716 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND1O60716 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms