Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms