Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARPC1BO15143 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms