Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARVCFO00192 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARVCFO00192 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms