Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVV-1B6SEH8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVV-1B6SEH8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms