Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms