Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3BA8MYP8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms