Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228 ms