Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP27XA6NNY8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP27XA6NNY8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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