Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJE1A6NN92 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms