Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIPT2A6NK58 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms