Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6L4A6NEF3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms