Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EME2A4GXA9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EME2A4GXA9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EME2A4GXA9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EME2A4GXA9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms