Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SULT1C4-202ENST00000409309 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC023154.1-203ENST00000508813 2465 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC091182.2-201ENST00000520431 578 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LMO3Q8TAP4 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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