Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 CYP4A22-202ENST00000371890 1780 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC010680.2-201ENST00000603521 2117 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZSCAN16-201ENST00000340487 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NR1I3-204ENST00000367982 1322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL109810.2-201ENST00000425559 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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