Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ITIH6-201ENST00000218436 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GABRP-203ENST00000518525 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CREM-224ENST00000468236 582 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC104938.1-203ENST00000561834 546 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SLC11A2-212ENST00000547688 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC048380.2-201ENST00000624725 3548 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TRIM16-202ENST00000416464 3184 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 EFCAB7-201ENST00000371088 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 ADAM3A-202ENST00000460383 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLR2AP24928 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms