Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GACAT1-201ENST00000419650 577 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC034228.1-201ENST00000424244 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01425-202ENST00000430060 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL138957.1-201ENST00000435156 342 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC02517-201ENST00000509453 492 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC136604.3-202ENST00000514793 485 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC022778.1-201ENST00000518302 545 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TPRXL-211ENST00000532880 754 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC078886.1-201ENST00000549144 554 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC023983.2-201ENST00000608010 562 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PHACTR2-AS1-201ENST00000450575 1699 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CASP4-201ENST00000393150 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC018880.1-201ENST00000418898 1319 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 GAGE2A-201ENST00000362097 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 IGLV11-55-201ENST00000390286 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SNORD86-201ENST00000391196 86 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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PDCD1Q15116 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 DAZAP2P1-201ENST00000475212 503 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC138907.7-202ENST00000565347 540 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC141257.2-201ENST00000569199 540 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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