Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms