Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms