Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF6Q9Y4K3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms