Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF330Q9Y3S2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms