Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC2Q9Y235 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC2Q9Y235 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms