Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC5Q9UQL6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC5Q9UQL6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms