Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNMA2Q9UL42 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNMA2Q9UL42 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms