Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF346Q9UL40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF346Q9UL40 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF346Q9UL40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF346Q9UL40 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF346Q9UL40 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms